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随着画上句号,开启了本世纪第三个十年。 在各大期刊和媒体的盘点中,过去一年,生命科学不断取得突破,成果丰硕。 这使得科研人员难以攻击,资源平台的支持也挥之不去。

这一年,国家基因库继续开放平台,共享资源,促进生存、读取、写入、研究、学、产,为我国生命科学技术探索和保驾护航。 在送走旧年、迎接新年之际,让我们回顾一下国库这一年的成长、收获和成果光盘。

▲图:国家基因库

一、期盼新年,载着梦想前进

国家基因库主任王韧性新年留言:

年,在深圳国家基因库理事会的领导下,国家基因库在支撑生命科学研究和生物领域快速发展方面发挥了重要意义,提高了国库基础设施的能力和科技水平,进一步扩大了对外开放共享和支持服务。

年,国家基因库继续发挥公益性、开放性、支撑性和引领性,积极响应十三五的号召,以推进核心技术创新突破、支持科研、赋能产业为己任,提高支撑服务水平,深化开放共享,推动我国生命科学技术快速发展和广东

二、与时俱进,铸造高地

铸造中国生命科技战术的新高地

这一年,国库实力再次更新。

上千个级别的样本存储功能

8Pb数据存储能力

61兆次/秒的计算能力

24pb/年的数据生产率

数千碱/年的高效合成能力

在此基础上,支持许多科研成果的发表

运营以来,sci收录的副本累计达到409篇

增加包含26篇cnns的193篇

积极参与国际、国内相关标准的制定

实施的达到31件,增加了7件。

包括我国生物样品库建设行业首个国标

生命大数据平台( cngbdb )

存档数据总量超过1.5pb

对外共享47.7万条生物样本新闻

服务客户来自237个机构

支持百余篇论文在60多个国际期刊上发表

(注:数据统计截至12月31日)

三、前沿布局、自主自强

数字的稳步增长来源于技术基础的不断巩固。 国库多次领导着先进的引进和创新,是先进的技术应用平台、自主可控的核心工具,持续提高着支持服务水平。

建设生命科学数据汇交标准体系,国家基因库生命大数据平台( cngbdb、dbgb )结合知识图谱、自然语言解决等技术发布ai各大搜索引擎,基于多种安全技术自行搭建生命科学可靠的共享平台,

▲图:国家基因库生命大数据平台( cngbdb )

这一年,国库建立了先进的单细胞测序平台,实现了数千万级的单细胞生产能力,打破了对国外设备和技术的依赖,为单细胞行业的基础研究和医学研究提供了有力的技术支持。

国库引入精确的基因组测序技术,从一开始就组装二倍体染色体,能够将基因组测序真正带入全高清时代,提供更全面准确的遗传新闻。

面对诸多复杂多变的外部形势,国库大规模配置国产化测序设施,与国内合作伙伴合作完成了基于国产自研芯片的wgs生物信号分解流程的配置。 核心工具可以自主控制,大大增强国库抵御外部不可控风险的能力。

四、支持项目,全面出力

在一带一路和粤港澳大湾区快速发展倡议的指导下,国库以资源、数据为能源,以技术、设施为引擎,在未来农业、医疗健康、生物多样化、合成生物学等多个行业发力,为国际大型、国家级、省级重大科研项目输送动力。

1 .农业:促进精确育种,辅助害虫防控

百农为本,民以食为天。 在国库平台的支持下,科研人员对种质资源或相关害虫的遗传新闻进行读取、挖掘和组学研究,为改良作物品种、防治病虫害、提高作物产量和质量、改善相关地区民生提供力量。

1 )鹰嘴豆的重序列决定项目:

与国际半干旱热带作物研究所( icrisat )等机构合作,完成9000株不同鹰嘴豆品种的全基因组重排,培育高产、抗逆品种,对快速发展我国农业生产力具有重要作用。

2 )草地贪婪夜蛾参考基因组构建

支持了世界首个草地贪夜蛾优质染色体水平基因组的建立,为精确防治这种外来入侵害虫提供了极有价值的科学依据。 基因组数据通过cngbdb向世界科学家公开。

3 )大豆回家公益专项计划

完成了3500份野生大豆种质资源数字化,开始了600种种质资源杂交组合的测序和分解,帮助世界科学家培育出适应环境变化和人口增长的新作物。

2 .医疗健康:促进精准医疗的快速发展,促进以前流传下来的医药现代化。

学习大数据是正确医疗的基础。 国库以强大的平台实力支持医学和药物行业众多的组学研究,建设相关数据资源共享平台,促进国际、国内精准医疗事业的快速发展。

1 )单细胞大数据脑科学研究项目

该项目利用单细胞多组学测序技术制作非人灵长类的大脑基因图谱,建立外部可访问的数据库。 约40万食蟹猴单细胞转录组和表观遗传学数据的生产完成。

2 )大规模自然群列的示范研究

国库支持中国医学院主导的这项国家要点研发计划,为人群排项目建设提供规范化、本土化指导依据,促进优质样品资源的收集与利用。 已经发布了团体标准1项,参与了专业书籍的制作,获得了软件著作权1项。

3 )万种药用植物数据库( 10kmp )

与广西药用植物园合作建立,目前已输入近千种药用植物的组学数据。 将药用植物转换为比较有效成分确定、疗效可靠、质量稳定的中药新药方向,辅助新药的设计。

3 .生物多样化保育:进行遗传资源数字化,推进生物多样化保育

作为现代诺亚方舟,国库保存着生物遗传资源。 并与国内外多家科研机构合作,以数字化的方法,永久保存和系统挖掘生物遗传新闻,以基因科技+大数据的力量,推进生物多样化保护。

1 )反刍动物基因组计划

该项目由西北工业大学等机构主导,开辟了研究重大生命现象的新途径,项目成果对反刍动物基因组进化和人类健康的启示入选了年度中国生命科学的十大进展。 年6月在顶级学术杂志《科学》上以封面影印的形式发表了一系列研究成果。

财讯:盘点国家基因库2019|韶光不负,未来可期

2 )瑞丽珍稀植物园数字化项目

国库与云南德宏州瑞丽市林业局共同开展,对园中采集的761份植物样品进行了高深度测量,完成了世界第一个生态型植物园基因组数字化研究,产出的54tb组学数据由cngbdb对外共享。

3 )千种植物转录组计划( 1kp )

由全球约200名植物科学家组成的1kp国际联盟,历时9年,公布了1,178种植物转录组测序的成果。 基于项目成果构建的1kp数据库通过cngbdb对外开放共享。

4 .合成生物学:基于高通量dna合成能力,支持合成生物学的前沿探索

合成生物学技术被称为继dna双螺旋发现、人类基因组计划之后的生命科学第三次革命。 作为开放共享的合成生物学技术支持和创新平台,国库将为该行业的前沿探索和技术应用提供重要的助力。

1 )真核微生物基因组的人工设计与合成

该项目是国家要点研发计划项目的合成生物学要点专业,为明确真核微生物基因组的设计规律、建立基因组合成新技术奠定基础,将于年获得批准。 国库为项目提供高通量dna合成支持。

2 ) dna存储技术和应用开发

该项目是深圳合成生物学创新研究院的专项项目,为推动dna存储技术的快速发展、开发基于潜在dna存储的加密解密技术提供技术基础和支撑,为基因新闻存储注入新概念。 国库为项目提供dna合成和软件开发支持。

5 .伦理与合规:参与国家要点项目,推进指导方针、纲领建设

科学技术是一把双刃剑,其快速发展和应用需要伦理、法规的指导和约束。 引领科学研究和产业健康、快速发展,国库参与许多国家级要点项目,与众多参与机构合作,对比合成生物学、生物样本资源等进行伦理研究、公共教育,为制定完整配套的伦理指南和管理纲领做出贡献。

财讯:盘点国家基因库2019|韶光不负,未来可期

1 )《合成生物学伦理、政策法规框架研究》

该项目隶属于科技部年合成生物学要点专业,推动建立国家级合成生物学伦理指导委员会和国家级科普教育基地,为合成生物学国家要点研发计划的继续实施提供伦理论证、政策建议,并与国际组织联合发表《合成生物学伦理宣言》。 国库第一参与子课题4 :合成生物技术政策、科学传播、公众参与的系统平台构建。

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2 )“大数据时代生物样本库的哲学研究”

该项目是年度国家社会科学基金的重大项目,国库组织、拆解生物样本库的基本概况和管理现状,以及生物样本库样本和数据开放共享中的伦理、法律、管理问题,形成员工指南。

资源、平台、创新永不停止。 开放、共享、步履不停。 这是国库人对过去的总结,也是对未来的决心。

万象更新,使命依然。 生命科学前沿依然发生云涌、百舸争流,国家基因库也将继续明灯引导、强风助帆。

关于国家基因库:

年,深圳国家基因库( china national genebank,cngb )在国家快速发展改革委员会、财政部、工业和新闻化部、卫生健康委员会(原卫生部)四部委批准建设、以国家快速发展改革委员会和深圳市政府为联合理事长单位的理事会指导下,在深圳市政府,

财讯:盘点国家基因库2019|韶光不负,未来可期

深圳国家基因库是世界领先的国家级综合性基因库,它存储、读取、写入遗传资源,即生物资源和基因数据,读取、合成运用遗传新闻,在此基础上挖掘基因资源,生命科学研究和生物产业创新的快速

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